Ministerul de Finanţe precizează că Ministerul Economiei poate îşi exercită mai bine calitatea de acţionar, deoarece deţine şi celelalte participaţii ale statului la firme energetice. În octombrie 2003, Guvernul a emis o ordonanţă privind transformarea în obligaţiuni a restanţelor bugetare ale Rompetrol, în valoare de 603 milioane de dolari la acea vreme.
La 30 septembrie 2010, data scadentă răscumpărării obligaţiunilor, Rompetrol Rafinare înapoiase doar 71 de milioane de dolari, astfel încât restul datoriilor au fost convertite în acţiuni şi virate statului român. Ulterior, statul a contestat în instanţă decizia Rompetrol de conversie a datoriilor, însă Tribunalul Constanţa a decis că Rompetrol Rafinare a procedat legal. Ministerul Finanţelor a depus recurs la această decizie.