Karagici, care se consideră nevinovat, a anunţat că va boicota procesul, sub motiv că nu a avut timp să îşi pregătească apărarea. La proces vor fi prezenţi supravieţuitori ai masacrului de la Srebreniţa, ordonat de Karagici şi de generalul sârb Ratko Mladici în iulie 1995, în urma căruia au murit peste 7.000 de musulmani bosniaci. Această baie de sânge reprezintă una dintre cele mai întunecate pagini ale istoriei Europei de după cel de-al doilea război mondial.
Karagici a fost arestat la Belgrad, pe 21 iulie 2008. El susţine că a beneficiat de un acord de imunitate încheiat în 1996 cu negociatorul american Richard Holbrooke, în schimbul retragerii din viaţa politică. Diplomatul citat a negat existenţa unui asemenea acord, iar Tribunalul Penal Internaţional a avertizat că nu recunoaşte asemenea înţelegeri.