El a promis că va continua politica predecesorului său, Alvaro Uribe, împotriva gherilelor marxiste. Santos va fi învestit în funcţie pe 7 august.Viitorul preşedinte este apreciat pentru ofensiva încununată de succes împotriva rebelilor din FARC, gherila pe care guvernul de la Bogota, Statele Unite şi Uniunea Europeană o consideră o organizaţie teroristă.
Juan Manuel Santos este cel care, în calitate de ministru al Apărării, a organizat salvarea fostei candidate la funcţia supremă Ingrid Betancourt, ostatică timp de şase ani a FARC. Unii îi reproşează însă lui Santos anumite execuţii extrajudiciare la care armata ar fi recurs pe timpul mandatului său.
