Daniel-Petru Funeriu a absolvit, în 1994, European Higher Institute of Chemistry din Strasbourg, Franţa, unde a obţinut titlul de inginer în chimie, specializarea chimie organică. Între anii 1994 şi 1995, a urmat un program de masterat în chimie organică şi supramoleculară la Universitatea Louis Pasteur, tot din Strasbourg. În perioada 1995-1999, şi-a definitivat studiile de doctorat la aceeaşi universitate, concretizate cu teza de doctorat realizată sub îndrumarea profesorului J.-M. Lehn, laureat al premiului Nobel pentru chimie.
Funeriu a fost asistent universitar la Universitatea Louis Pasteur din Strasbourg între anii 1995 şi 1998, apoi conferenţiar, din 1998 până în 1999, la College de France din Paris. A fondat, în 1994, Asociaţia Studenţilor Români din Strasbourg, pe care a şi condus-o, între 1994 şi 1998. În perioada 1999-2002, a fost cercetător ştiinţific la Scrips Research Institute din LaJolla, California, SUA, iar între 2005 şi 2006, s-a numărat printre membrii Consiliului Director al Asociaţiei Ad-Astra.
Din 2002 până în 2006, Funeriu a fost cercetător ştiinţific şi liderul unui proiect de cercetare în domeniul nanotehnologiilor, la National Institute of Advanced Industrial Science and Technology din Osaka, Japonia. Din 2006, este beneficiarul unui grant de cercetare de aproximativ două milioane de euro în domeniul deconvoluţiei sistemelor biochimice complexe din partea Uniunii Europene. În 2007, Funeriu a devenit membru în grupul de experţi pentru elaborarea “Strategiei cercetării din România între 2007 şi 2013”.
Daniel-Petru Funeriu este şi team-leader în cadrul echipei Marie Curie Excellence de la Universitatea Tehnică din Munchen, Germania, şi principal investigator în cadrul IGGSE (International Graduate School of Science and Engeneering)s de la aceeaşi instituţie.
În 2007, a candidat la alegerile europarlamentare, fiind al patrulea pe lista PDL. În urma scorului obţinut de acest partid, au devenit europarlamentari primii trei, respectiv Theodor Stolojan, Dumitru Oprea şi Nicolae Vlad Popa.